עמותת העטלף (ע"ר) הינה הארגון הרשמי של בוגרי שייטת 13.

חזון העטלף: מהובלה צבאית למנהיגות אזרחית

עמותת העטלף שמה לה למטרה לפתח ולהעצים את בוגרי שייטת 13 לקהילה אזרחית מובילה, תורמת ובונה בחברה הישראלית, בדיוק כפי שהיו אומנו בעת שירותם הצבאי. שורשינו נעוצים ביחידה המובחרת והייחודית, שמתאפיינת בערכי הרעות והדבקות במשימה. 

העמותה הינה מוסד ללא כוונת רווח והיא פועלת בשלושה מעגלים:

1. היחידה
2. הבוגרים חברי העמותה
3. החברה הישראלית

עמותת העטלף הוקמה בשנת 1984 ע"י וותיקי היחידה, במטרה לשמר את האיכויות האנושיות המיוחדות של בוגרי היחידה ולהמשיך לפעול למענם ולמען החברה הישראלית. מאז הלכה העמותה והתפתחה בהתאם למציאות המשתנה ולצו השעה. בשנים האחרונות רוב הפרויקטים של עטלף מייצגים עשייה של בוגרי היחידה למען החברה הישראלית, בעיקר בתחום סיוע לפצועים והסובלים מפוסט טראומה, על ידי חיבור אישי ואנושי.